Năm 2005, cùng với Markis Kido, anh chiến thắng tại nội dung đôi nam ở Giải vô địch cầu lông châu Á và Indonesia Mở rộng. Cũng trong năm 2006, họ chiến thắng tại các giải Truyền hình Jakarta, giải Cầu lông Hồng Kông Mở rộng và giải Cầu lông Trung Quốc mở rộng sau khi đánh bại đương kim vô địch Giải vô địch cầu lông Thế giới 2006, Cai Yun và Fu Haifeng của Trung Quốc trong trận chung kết.
Năm 2007 là một năm thành công với Setiawan và Kido. Họ giành chức vô địch thế giới sau khi đánh bại Jung Jae-sung và Lee Yong-dae của Hàn Quốc, 21–19 và 21–19, trong trận chung kết Giải vô địch thế giới ở Kuala Lumpur, Malaysia. Họ cũng giành chức vô địch Trung Quốc mở rộng sau khi đánh bại Guo Zhendong và Xie Zhongbo của Trung Quốc và World Cup Invitation sau khi đánh bại Mohd. Fairuzizuan Mohd. Tazari và Lin Woon Fui của Malaysia ở Ích Dương, Hồ Nam. Trong tháng 7 họ về nhì tại giải Masters Trung Quốc, lần này họ đã thất bại trước Cai Yun và Fu Haifeng, 15–21, 16–21. Họ thắng giải Grand Prix Gold Đài Loan vào tháng 9 trước cặp đôi kỳ cựu Lars Paaske và Jonas Rasmussen của Đan Mạch. Vào tháng 12 họ thắng giải Hồng Kông Mở rộng sau khi vượt qua hai trong số những tay vợt xuất sắc nhất lúc đó của Indonesia là Candra Wijaya và Tony Gunawan 21–12, 18–21, 21–13 trong trận chung kết. Tại Đại hội thể thao Đông Nam Á ở Thái Lan, họ giúp Indonesia giành huy chương vàng Đồng đội nam, và giành huy chương vàng Đôi nam cho cá nhân sau khi đánh bại Hendri Kurniawan Saputra và Hendra Wijaya, hai tay vợt gốc Indonesia thi đấu cho Singapore.
Tháng 1 năm 2008 họ thắng giải Malaysia Mở rộng. Tháng 8 năm 2008 họ được giành giải
thưởng danh giá nhất của mình, tại Thế vận hội Bắc Kinh 2008. Họ giành huy chương vàng Đôi nam sau khi đánh bại Cai Yun và Fu Haifeng của Trung Quốc 12–21, 21–11, 21–16, nhờ đó phục thù thất bại tại giải Masters Trung Quốc 2007. Tháng 9 năm 2008 Setiawan cùng với Kido thắng giải Super Series Masters Trung Quốc sau khi đánh bại cặp đôi của Trung Quốc Sun Junjie và Xu Chen tại trận chung kết. Vào tháng 10 họ thắng giải Đan Mạch Mở rộng sau khi đánh bại một cặp đôi khác của Trung Quốc, Fu Haifeng và Shen Ye trong trận chung kết. Vào tháng 11 tại Paris, họ có thêm chức vô địch Pháp mở rộng sau khi tiếp tục đánh bại một cặp đôi Trung Quốc khác, Cai Yun và Xu Chen.
Tháng 1 năm 2009 họ thắng giải Malaysia Mở rộng. Tháng 9 năm 2009 họ thắng giải Nhật Bản mở rộng sau khi đánh bại một cặp đôi Indonesia khác, Rian Sukmawan và Yonathan Suryatama 21–19 và 24–22 trong trận chung kết. Tháng 10 năm 2009 họ thắng giải Pháp Mở rộng.
Ngày 17 tháng 12 năm 2009, họ đánh bại cặp đôi Malaysia Koo Kien Keat / Tan Boon Heong để giành Huy chương vàng Đại hội Thể thao Đông Nam Á 2009.
Họ tiếp tục chứng tỏ sự thống trị khi giành Huy chương vàng tại Đại hội Thể thao châu Á 2010 ở Quảng Châu, Trung Quốc sau khi đánh bại Koo Kien Keat và Tan Boon Heong.
Hiện tại Setiawan đánh cặp cùng người đồng đội trẻ tuổi hơn là Mohammad Ahsan. Họ chiến thắng giải đấu đầu tiên tại giải Malaysia Mở rộng sau khi đánh bại cặp đôi Hàn Quốc Lee Yong-dae và Ko Sung-hyun 21-15, 21-13 trong trận chung kết. Họ cũng giành giải Super Series Premier Indonesia 2013 sau khi lại thắng Lee Yong-dae và Ko Sung-hyun 21-14 và 21-18. Một lần nữa, họ đánh bại cặp đôi Hàn Quốc tại chung kết một giải super series, 21-15 and 21-18 tại Super Series Singapore 2013 ngày 23 tháng 6 năm 2013. Tháng 8 năm 2013, họ trở thành nhà vô địch thế giới sau khi chiến thắng tại Giải vô địch cầu lông thế giới 2013, đánh bại cặp đôi Đan Mạch Mathias Boe và Carsten Mogensen 21-13, 23-21, và họ vô địch với việc không thua bất cứ game đấu nào từ đầu giải.
Đôi nam cùng với Muhammad Ahsan
Đôi nam cùng với Markis Kido
Khi còn trẻ, anh gia nhập câu lạc bộ cầu lông Jaya Raya Jakarta. Bố mẹ của Setiawan tên là Ferry Yoegianto (bố) và Kartika Christyaningrum (mẹ). Sở thích của anh là nghe nhạc. Mọi người thường gọi anh là Hendra hoặc Junkies. Chị của anh Sylvia Anggraeny đã cưới ngôi sao cầu lông đã giải nghệ Hendrawan.
Giải cầu lông Nhật Bản Mở rộng 2025 (tên chính thức Daihatsu Japan Open 2025) là một giải đấu cầu lông diễn ra tại Nhà thi đấu Tokyo Metropolitan ở Tokyo, Nhật Bản, từ ngày 15 đến ngày 20 tháng 7 năm 2025 với tổng giải thưởng lên tới 950.000 đô la, tương đương 25 tỷ đồng. Giải Nhật Bản mở rộng 2025 là giải đấu thứ 17 của World Tour 2025, có đẳng cấp Super 750. Cầu lông Việt Nam hiện nay chỉ có Nguyễn Thùy Linh đủ điều kiện tranh tài, nhưng cô không tham dự.
